Na capela-mor, a repintura oitocentista da abóbada, feita em imitação ao estilo do século XIV, harmoniza-se com a obra Juízo Final afrescada na parede direita. A obra remonta à segunda metade do século XIV e é atribuída ao chamado “Segundo Mestre de San Zeno”.
À esquerda, encontra-se o excêntrico monumento funerário do condottiero scaligero Cortesia Serègo, realizado pelo toscano Pietro Niccolò Lamberti em colaboração com o pintor Michele Giambono, entre 1424 e 1429. Esta obra foi executada nos mesmos anos em que outra dupla de artistas, Pisanello e o escultor Nanni di Bartolo, trabalhava no mesmo tema para o Mausoléu Brenzoni, na vizinha Igreja de San Fermo. O altar foi modernizado em 1952. Os vitrais da abside, datados de 1935, representam, da esquerda para a direita: São Tomás, Santa Catarina de Siena, São Pedro Mártir, Santa Rosa de Lima e São Domingos. Em frente à capela-mor, pode-se admirar a parte mais bela do pavimento quinhentista: uma rosácea com um sol ao centro, símbolo dos dominicanos.
